In der neu geschaffenen FlightCrew Academy wird die Ausbildung zum Piloten "ab initio" angeboten. Sie richtet sich an Bewerber, die den Beruf von der Pike auf lernen wollen und noch keine Piloten-Lizenzen haben. Die FlightCrew Academy plant, jährlich 120 Piloten in jeweils sechs Kursen mit 20 Schülern auszubilden.
Die Pilotenanwärter durchlaufen ein 17-monatiges Trainingsprogramm in Theorie und Praxis. Der theoretische Unterricht findet im Lufthansa Flight Training Center auf Frankfurt am Main (FRA) statt. Die ersten fliegerischen Praxis-Erfahrungen werden die angehenden Piloten auf dem internationalen Flughafen Zadar (ZAD) in Kroatien sammeln. Während der Ausbildung betreuen Piloten von Germanwings und Lufthansa CityLine die Flugschüler intensiv und führen sie an ihren zukünftigen Arbeitsplatz heran.
Nach erfolgreichem Abschluss mit der Lizenz für Verkehrspiloten (ATPL) werden die Flugschüler bei Bedarf und Eignung in Simulatoren auf den jeweiligen Flugzeugmustern ihrer neuen Arbeitgeber (Germanwings oder Lufthansa CityLine) geschult.